Flemming Steen Jørgensen

Flemming Steen Jørgensen

Professor


  1. 2002
  2. Udgivet

    Assessing the relative importance of the biophysical properties of amino acid substitutions associated with human genetic disease

    Terp, B. N., Cooper, D. N., Christensen, I. T., Jørgensen, Flemming Steen, Bross, P. G., Gregersen, Niels Henrik & Krawczak, M., 2002, I: Human Mutation. 20, 2, s. 98-109 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Structural differences of matrix metalloproteinases with potential implications for inhibitor selectivity examined by the GRID/CPCA approach

    Terp, G. E., Cruciani, G., Christensen, I. T. & Jørgensen, Flemming Steen, 2002, I: Journal of Medicinal Chemistry. 45, 13, s. 2675-84 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Human peptide transporters: Therapeutic applications

    Nielsen, C. U., Larsen, Birger Brodin, Jørgensen, Flemming Steen, Frøkjær, Sven & Steffansen, B., 1 sep. 2002, I: Expert Opinion on Therapeutic Patents. 12, 9, s. 1329-1350 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. 2004
  6. Udgivet

    Computeren kan forudsige lægemidlers omdannelse

    Olsen, L., Bergmann, R. & Jørgensen, Flemming Steen, 2004, I: Lægemiddelforskning 2004.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  7. Udgivet

    Docking and scoring of metallo-beta-lactamases inhibitors

    Olsen, L., Pettersson, I., Hemmingsen, L., Adolph, H. & Jørgensen, Flemming Steen, 2004, I: Journal of Computer - Aided Molecular Design. 18, 4, s. 287-302 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Evaluation and comparison of 3D-QSAR CoMSIA models for CDK1, CDK5, and GSK-3 inhibition by paullones

    Kunick, C., Lauenroth, K., Wieking, K., Xie, X., Schultz, C., Gussio, R., Zaharevitz, D., Leost, M., Meijer, L., Weber, A., Jørgensen, Flemming Steen & Lemcke, T., 2004, I: Journal of Medicinal Chemistry. 47, 1, s. 22-36 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Homology building as a means to define antigenic epitopes on dihydrofolate reductase (DHFR) from Plasmodium falciparum

    Alifrangis, Michael, Christensen, I. T., Jørgensen, Flemming Steen, Rønn, A. M., Weng, J. E., Chen, M., Bygbjerg, Ib Christian, Sirawaraporn, W., Palarasah, Y. & Koch, C., 2004, I: Malaria Journal. 3, s. 16

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Isolation of a library of aromadendranes from Landolphia dulcis and its characterization using the VolSurf approach

    Stærk, Dan, Skole, B., Jørgensen, Flemming Steen, Budnik, B. A., Ekpe, P. & Jaroszewski, J. W., 2004, I: Journal of Natural Products. 67, 5, s. 799-805 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Structural analysis of CYP2C9 and CYP2C5 and an evaluation of commonly used molecular modeling techniques

    Afzelius, L., Raubacher, F., Karlén, A., Jørgensen, Flemming Steen, Andersson, T. B., Masimirembwa, C. M. & Zamora, I., 2004, I: Drug Metabolism and Disposition. 32, 11, s. 1218-29 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. 2005
  13. Udgivet

    Conformational restrictions in ligand binding to the human intestinal di-/tripeptide transporter: implications for design of hPEPT1 targeted prodrugs

    Våbenø, J., Nielsen, C. U., Steffansen, B., Lejon, T., Sylte, I., Jørgensen, Flemming Steen & Luthman, K., 2005, I: Bioorganic & Medicinal Chemistry. 13, 6, s. 1977-88 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Forudsigelser med hjælp fra det virtuelle rum

    Andersen, R., Steffansen, B., Jørgensen, Flemming Steen & Nielsen, C. U., 2005, I: Lægemiddelforskning. s. 24-25

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  15. Udgivet

    Prediction methods and databases within chemoinformatics: emphasis on drugs and drug candidates

    Jónsdóttir, S. O., Jørgensen, Flemming Steen & Brunak, Søren, 2005, I: Bioinformatics. 21, 10, s. 2145-60 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. 2006
  17. Udgivet

    Development of a QSAR model for binding of tripeptides and tripeptidomimetics to the human intestinal di-/tripeptide transporter hPEPT1

    Andersen, R., Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, L., Våbenø, J., Thorn, K., Nielsen, C. U. & Steffansen, B., 2006, I: Pharmaceutical Research. 23, 3, s. 483-92 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Hvad har varme at gøre med lægemidler?

    Olsen, L., Kasper, C., Kastrup, Jette Sandholm Jensen, Gajhede, Michael & Jørgensen, Flemming Steen, 2006, I: Lægemiddelforskning. s. 31-33

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  19. Udgivet

    Identification of a gene on chromosome 12q22 uniquely overexpressed in chronic lymphocytic leukemia

    Buhl, A. M., Jurlander, J., Jørgensen, Flemming Steen, Ottesen, A. M., Cowland, J. B., Gjerdrum, L. M., Hansen, B. V. & Leffers, H., 2006, I: Blood. 107, 7, s. 2904-11 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    In vitro evaluation of N-methyl amide tripeptidomimetics as substrates for the human intestinal di-/tri-peptide transporter hPEPT1

    Andersen, R., Nielsen, C. U., Begtrup, M., Jørgensen, Flemming Steen, Larsen, Birger Brodin, Frøkjær, Sven & Steffansen, B., 2006, I: European Journal of Pharmaceutical Sciences. 28, 4, s. 325-35 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    New leads of metallo-beta-lactamase inhibitors from structure-based pharmacophore design

    Olsen, L., Jost, S., Adolph, H., Pettersson, I., Hemmingsen, Lars Bo Stegeager & Jørgensen, Flemming Steen, 2006, I: Bioorganic & Medicinal Chemistry. 14, 8, s. 2627-2635 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. 2007
  23. Udgivet

    Computational prediction of solubilizers' effect on partitioning

    Høst, J., Christensen, I. T., Jørgensen, Flemming Steen, Frøkjær, Sven & Hovgaard, L., 2007, I: Internation Journal of Pharmaceutics. 329, 1-2, s. 46-52

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Determination of protein conformation by isotopically labelled cross-linking and dedicated software: Application to the chaperone, calreticulin

    Nielsen, T., Thaysen-Andersen, M., Larsen, N., Jørgensen, Flemming Steen, Houen, G. & Højrup, P., 2007, I: International Journal of Mass Spectrometry. 268, 2-3, s. 217-226

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Study on the binding of Thioflavin T to ß-sheet-rich and non-ß-sheet cavities

    Jensen, M. G., Olsen, L., van de Weert, Marco, Flink, J. M., Frøkjær, Sven & Jørgensen, Flemming Steen, 2007, I: Journal of Structural Biology. 158, 3, s. 358-369

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2008
  27. Udgivet

    QSAR models for the human H+/peptide symporter, hPEPT1: Affinity prediction using alignment-independent descriptors

    Larsen, S. B., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 2008, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 48, 1, s. 233-241

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Risiko for hjerteflimmer afsløres med computermodel

    Taboureau, O., Brunak, S. & Jørgensen, Flemming Steen, 2008, I: Lægemiddelforskning. s. 31-33

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  29. Udgivet

    Small angle X-ray scattering study of calreticulin reveals conformational plasticity

    Toft, K. N., Larsen, N., Jørgensen, Flemming Steen, Højrup, P., Houen, G. & Vestergaard, Bente, 2008, I: BBA General Subjects. 1784, 9, s. 1265-1270

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Solvent diversity in polymorph screening

    Allesø, M., van der Berg, Franciscus Winfried J, Cornett, Claus, Jørgensen, Flemming Steen, Halling-Sørensen, B., Lopez de Diego, H., Hovgaard, L., Aaltonen, J. & Rantanen, Jukka, 2008, I: Journal of Pharmaceutical Sciences. 97, 6, s. 2145-2159

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. 2009
  32. Udgivet

    Classification of cytochrome P450 1A2 inhibitors and noninhibitors by machine learning techniques

    Poongavanam, V., Taboureau, O., Oostenbrink, C., Vermeulen, N. P. E., Olsen, L. & Jørgensen, Flemming Steen, 2009, I: Drug Metabolism and Disposition. 37, 3, s. 658-664

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Computeren er medicinalkemikerens arbejdshest

    Larsen, S. B., Olsen, L. & Jørgensen, Flemming Steen, 2009, I: Lægemiddelforskning. s. 7-9

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  34. Udgivet

    Discovery of ligands for the human intestinal di-/tripeptide transporter (hPEPT1) using af QSAR-assisted virtual screening strategy

    Larsen, S. B., Omkvist, D. H., Larsen, Birger Brodin, Nielsen, C. U., Steffansen, B., Olsen, L. & Jørgensen, Flemming Steen, 2009, I: ChemMedChem. 4, 9, s. 1439-1445

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Virtual screening and prediction of site of metabolism for cytochrome P450 1A2 ligands

    Poongavanam, V., Hritz, J., Taboureau, O., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen, Vermeulen, N. P. E. & Oostenbrink, C., 2009, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 49, 1, s. 43-52

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. 2010
  37. Udgivet

    A diversity optimized combinatorial library for the identification of Fc-fragment binding ligands

    Nielsen, A. L., Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, L., Christensen, S. F., Benie, A. J., Bjørnholm, T. & St. Hilaire, P. M., 2010, I: Biopolymers. 94, 2, s. 192-205

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    A quantitative structure-activity relationship for translocation of tripeptides via the human proton-coupled peptide transporter, hPEPT1 (SLC15A1)

    Omkvist, D. H., Larsen, S. B., Nielsen, C. U., Steffansen, B., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen & Larsen, Birger Brodin, 2010, I: The AAPS Journal. 12, 3, s. 385-396

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Biostructure-based drug design

    Jørgensen, Flemming Steen & Kastrup, Jette Sandholm Jensen, 2010, Textbook of drug design and discovery. Krogsgaard-Larsen, P., Strømgaard, K. & Madsen, U. (red.). 4 udg. Boca Raton: CRC Press, s. 29-42

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiUndervisning

  40. Udgivet

    Computational prediction of binding affinity for CYP1A2-ligand complexes using empirical free energy calculations

    Poongavanam, V., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen, Vermeulen, N. P. E. & Oostenbrink, C., 2010, I: Drug Metabolism and Disposition. 38, 8, s. 1347-1354

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Forbedret optagelse af lægemidler i organismen: computeren viser vejen

    Larsen, S. B., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 2010, I: Dansk Kemi. 91, 6/7, s. 18-20

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  42. Udgivet

    Homology modelling of the GABA transporter and analysis of tiagabine binding

    Skovstrup, S., Taboureau, O., Bräuner, Hans & Jørgensen, Flemming Steen, 2010, I: ChemMedChem. 5, 7, s. 986-1000

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Mutational mapping and modeling of the binding site for (S)-citalopram in the human serotonin transporter

    Andersen, J., Olsen, L., Hansen, K. B., Taboureau, O., Jørgensen, Flemming Steen, Jørgensen, A. M., Bang-Andersen, B., Egebjerg, J., Strømgaard, Kristian & Kristensen, Anders Skov, 2010, I: Journal of Biological Chemistry. 285, 3, s. 2051-2063

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. 2011
  45. Udgivet

    Identification of CYP1A2 ligands by structure-based and ligand-based virtual screening

    Poongavanam, V., Lastdrager, J., Oostenbrink, C., Commandeur, J. N. M., Vermeulen, N. P. E., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 2011, I: MedChemComm. 2, 9, s. 853-859

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    G protein- and agonist-bound serotonin 5-HT2A receptor model activated by steered molecular dynamics simulations

    Ísberg, V., Balle, T., Sander, T., Jørgensen, Flemming Steen & Gloriam, David E., 28 feb. 2011, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 51, 2, s. 315-325

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    In silico predictions of hERG channel blockers in drug discovery: from ligand-based and target-based approaches to systems chemical biology

    Taboureau, O. & Jørgensen, Flemming Steen, jun. 2011, I: Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 14, 5, s. 375-387

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. 2012
  49. Udgivet

    A robust force field based method for calculating conformational energies of charged drug-like molecules

    Pøhlsgaard, J., Harpsøe, Kasper, Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 2012, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 52, 2, s. 409-419

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    A steered molecular dynamics study of binding and translocation processes in the GABA transporter

    Skovstrup, S., David, L., Taboureau, O. & Jørgensen, Flemming Steen, 2012, I: P L o S One. 7, 6, s. e39360

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Prediction of pH-dependent aqueous solubility of druglike molecules

    Hansen, N. T., Kouskoumvekaki, I., Jørgensen, Flemming Steen, Brunak, Søren & Jónsdóttir, S. O., 2012, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 46, 6, s. 2601-2609 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Synthesis and antiangiogenic activity of N-alkylated levamisole derivatives

    Hansen, A. N., Bendiksen, C. D., Sylvest, L., Friis, T., Stærk, Dan, Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, Christian Adam & Houen, G., 2012, I: P L o S One. 7, 9, 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    hERG classification model based on a combination of support vector machine method and GRIND descriptors

    Li, Q., Jørgensen, Flemming Steen, Oprea, T., Brunak, Søren & Taboureau, O., 2012, I: Molecular Pharmaceutics. 5, 1, s. 117-127 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. 2014
  55. Udgivet

    Use of density functional theory in drug metabolism studies

    Rydberg, P., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., feb. 2014, I: Expert Opinion on Drug Metabolism & Toxicology. 10, 2, s. 215-27 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    Design of prodrugs targeting the intestinal di/tri‐peptide transporter hPEPT1 (SLC15A1

    Omkvist, D. H., Nielsen, C. U., Steffansen, B., Larsen, S. B., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen & Larsen, Birger Brodin, 4 apr. 2014. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  57. 2015
  58. Udgivet

    Salt-bridge Swapping in the EXXERFXYY Motif of Proton Coupled Oligopeptide Transporters

    Aduri, N. G., Prabhala, B. K., Ernst, H. A., Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, L. & Mirza, Osman Asghar, 2015, I: The Journal of Biological Chemistry. 290, 50, s. 29931-29940 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  59. Udgivet

    Density functional theory study on the formation of reactive benzoquinone imines by hydrogen abstraction

    Leth, R., Rydberg, P., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 23 mar. 2015, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 55, 3, s. 660-6 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  60. Udgivet

    Prediction of cytochrome P450 mediated metabolism

    Olsen, L., Oostenbrink, C. & Jørgensen, Flemming Steen, 6 maj 2015, I: Advanced Drug Delivery Reviews. 86, s. 61-71 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  61. 2016
  62. Udgivet

    Cytochrome P450 Mediated Drug Metabolism

    Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen & Oostenbrink, C., 2016, New Horizons in Predictive Drug Metabolism and Pharmacokinetics. Wilson, A. G. E. (red.). Cambridge: Royal Society of Chemistry, s. 66-78 13 s. (RSC Drug Discovery, Bind 49).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  63. Udgivet

    Insights into regioselective metabolism of mefenamic acid by cytochrome P450 BM3 mutants through crystallography, docking, molecular dynamics, and free energy calculations

    Capoferri, L., Leth, R., Ter Haar, E., Mohanty, A. K., Grootenhuis, P. D. J., Vottero, E., Commandeur, J. M. N., Vermeulen, N. P. E., Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, L. & Geerke, D. P., mar. 2016, I: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 84, 3, s. 383-96 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 1302104