Albert J. Kooistra
Lektor
Farmaceutisk Informatik
Universitetsparken 2
2100 København Ø
- 2024
- Udgivet
Pharmacological Characterization of the Zebrafish (Danio Rerio) Histamine H1 Receptor Reveals the Involvement of the Second Extracellular Loop in the Binding of Histamine
McNaught-Flores, D. A., Kooistra, Albert J., Chen, Y. C., Arias-Montano, J. A., Panula, P. & Leurs, R., 2024, I: Molecular Pharmacology. 105, 2, s. 84-96Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
A community Biased Signaling Atlas
Caroli, J., Mamyrbekov, A., Harpsøe, Kasper, Gardizi, S., Dörries, L., Ghosh, E., Hauser, Alexander Sebastian, Kooistra, Albert J. & Gloriam, David E., 2023, I: Nature Chemical Biology. 19, s. 531–535Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GPCRdb in 2023: state-specific structure models using AlphaFold2 and new ligand resources
Pándy-Szekeres, Gáspár, Caroli, J., Mamyrbekov, A., Kermani, A. A., Keserű, G. M., Kooistra, Albert J. & Gloriam, David E., 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, D1, s. D395–D402Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Predicting the target landscape of kinase inhibitors using 3D convolutional neural networks
Kanev, G. K., Zhang, Y., Kooistra, Albert J., Bender, A., Leurs, R., Bailey, D., Würdinger, T., Graaf, C. D., de Esch, I. J. P. & Westerman, B. A., 2023, I: PLOS Computational Biology. 19, 9, 19 s., e1011301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
KiSSim: Predicting Off-Targets from Structural Similarities in the Kinome
Sydow, D., Aßmann, E., Kooistra, Albert J., Rippmann, F. & Volkamer, A., 2022, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 62, 10, s. 2600–2616Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The G protein database, GproteinDb
Pándy-Szekeres, Gáspár, Esguerra, M., Hauser, Alexander Sebastian, Caroli, J., Munk, C., Pilger, S., Keseru, G. M., Kooistra, Albert J. & Gloriam, David E., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, D1, s. D518-D525Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Discovery of Diaryl Ether Substituted Tetrahydrophthalazinones as TbrPDEB1 Inhibitors Following Structure-Based Virtual Screening
de Heuvel, E., Kooistra, Albert J., Edink, E., van Klaveren, S., Stuijt, J., van der Meer, T., Sadek, P., Mabille, D., Caljon, G., Maes, L., Siderius, M., de Esch, I. J. P., Sterk, G. J. & Leurs, R., 21 jan. 2021, I: Frontiers in Chemistry. 8, 10 s., 608030.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An online GPCR structure analysis platform
Kooistra, Albert J., Munk, C., Hauser, Alexander Sebastian & Gloriam, David E., 2021, I: Nature Structural and Molecular Biology. 28, 11, s. 875-878Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GPCR activation mechanisms across classes and macro/microscales
Hauser, Alexander Sebastian, Kooistra, Albert J., Munk, C., Heydenreich, F. M., Veprintsev, D. B., Bouvier, M., Babu, M. M. & Gloriam, David E., 2021, I: Nature Structural and Molecular Biology. 28, 11, s. 879-888Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GPCRdb in 2021: integrating GPCR sequence, structure and function
Kooistra, Albert J., Mordalski, S., Pándy-Szekeres, Gáspár, Esguerra, M., Mamyrbekov, A., Munk, C., Keserű, G. M. & Gloriam, David E., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, D1, s. D335-D343Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
KLIFS: an overhaul after the first 5 years of supporting kinase research
Kanev, G. K., de Graaf, C., Westerman, B. A., de Esch, I. J. P. & Kooistra, Albert J., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, D1, s. D562-D569Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure of the class D GPCR Ste2 dimer coupled to two G proteins
Velazhahan, V., Ma, N., Pándy-Szekeres, Gáspár, Kooistra, Albert J., Lee, Y., Gloriam, David E., Vaidehi, N. & Tate, C. G., 2021, I: Nature. 589, s. 148-153 +app 24 ppPublikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure-Based Virtual Screening for Ligands of G Protein-Coupled Receptors: What Can Molecular Docking Do for You?
Ballante, F., Kooistra, Albert J., Kampen, S., de Graaf, C. & Carlsson, J., 2021, I: Pharmacological Reviews. 73, 4, s. 527-565Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Differential GLP-1R Binding and Activation by Peptide and Non-peptide Agonists
Zhang, X., Belousoff, M. J., Zhao, P., Kooistra, A. J., Truong, T. T., Ang, S. Y., Underwood, C. R., Egebjerg, T., Šenel, P., Stewart, G. D., Liang, Y-L., Glukhova, A., Venugopal, H., Christopoulos, A., Furness, S. G. B., Miller, L. J., Reedtz-Runge, S., Langmead, C. J., Gloriam, D. E., Danev, R. & 2 flere, , 2020, I: Molecular Cell. 80, 3, s. 485-500Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Utilizing drug-target-event relationships to unveil safety patterns in pharmacovigilance
Hauser, Alexander Sebastian, Kooistra, Albert J., Sverrisdóttir, E. & Sessa, Maurizio, 2020, I: Expert Opinion on Drug Safety. 19, s. 961-968Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
Covalent Inhibition of the Histamine H3 Receptor
Wágner, G., Mocking, T. A. M., Kooistra, Albert J., Slynko, I., Ábrányi-Balogh, P., Keserű, G. M., Wijtmans, M., Vischer, H. F., de Esch, I. J. P. & Leurs, R., 11 dec. 2019, I: Molecules (Print Archive Edition). 24, 19 s., 4541.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
AstraZeneca-Sanger Drug Combination DREAM Consortium, A. D. C. D. C., 1 dec. 2019, I: Nature Communications. 10, 1, 17 s., 2674.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The Landscape of Atypical and Eukaryotic Protein Kinases
Kanev, G. K., de Graaf, C., de Esch, I. J. P., Leurs, R., Würdinger, T., Westerman, B. A. & Kooistra, Albert J., nov. 2019, I: Trends in Pharmacological Sciences. 40, 11, s. 818-832 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Alkynamide phthalazinones as a new class of TbrPDEB1 inhibitors (Part 2)
de Heuvel, E., Singh, A. K., Boronat, P., Kooistra, Albert J., van der Meer, T., Sadek, P., Blaazer, A. R., Shaner, N. C., Bindels, D. S., Caljon, G., Maes, L., Sterk, G. J., Siderius, M., Oberholzer, M., de Esch, I. J. P., Brown, D. G. & Leurs, R., 15 sep. 2019, I: Bioorganic & Medicinal Chemistry. 27, 18, s. 4013-4029 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Route to Prolonged Residence Time at the Histamine H1 Receptor: Growing from Desloratadine to Rupatadine
Bosma, R., Wang, Z., Kooistra, Albert J., Bushby, N., Kuhne, S., van den Bor, J., Waring, M. J., de Graaf, C., de Esch, I. J., Vischer, H. F., Sheppard, R. J., Wijtmans, M. & Leurs, R., 25 jul. 2019, I: Journal of Medicinal Chemistry. 62, 14, s. 6630-6644 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Aminergic GPCR-Ligand Interactions: A Chemical and Structural Map of Receptor Mutation Data
Vass, M., Podlewska, S., De Esch, I. J. P., Bojarski, A. J., Leurs, R., Kooistra, Albert J. & De Graaf, C., 2019, I: Journal of Medicinal Chemistry. 62, 8, s. 3784-3839 56 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
Development of novel fluorescent histamine H1-receptor antagonists to study ligand-binding kinetics in living cells
Stoddart, L. A., Vernall, A. J., Bouzo-Lorenzo, M., Bosma, R., Kooistra, Albert J., De Graaf, C., Vischer, H. F., Leurs, R., Briddon, S. J., Kellam, B. & Hill, S. J., 1 dec. 2018, I: Scientific Reports. 8, 1, 1572.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Structural insights into serotonin receptor ligands polypharmacology
Podlewska, S., Kafel, R., Lacivita, E., Satała, G., Kooistra, Albert J., Vass, M., de Graaf, C., Leopoldo, M., Bojarski, A. J. & Mordalski, S., 10 maj 2018, I: European Journal of Medicinal Chemistry. 151, s. 797-814 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Chemical Diversity in the G Protein-Coupled Receptor Superfamily
Vass, M., Kooistra, Albert J., Yang, D., Stevens, R. C., Wang, M. W. & de Graaf, C., 1 maj 2018, I: Trends in Pharmacological Sciences. 39, 5, s. 494-512 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Synthesis and Characterization of a Bidirectional Photoswitchable Antagonist Toolbox for Real-Time GPCR Photopharmacology
Hauwert, N. J., Mocking, T. A. M., Da Costa Pereira, D., Kooistra, Albert J., Wijnen, L. M., Vreeker, G. C. M., Verweij, E. W. E., De Boer, A. H., Smit, M. J., De Graaf, C., Vischer, H. F., De Esch, I. J. P., Wijtmans, M. & Leurs, R., 28 mar. 2018, I: Journal of the American Chemical Society. 140, 12, s. 4232-4243 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 196033213
Flest downloads
-
113
downloads
GPCRdb in 2021: integrating GPCR sequence, structure and function
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
67
downloads
The Landscape of Atypical and Eukaryotic Protein Kinases
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
-
63
downloads
KLIFS: an overhaul after the first 5 years of supporting kinase research
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet